Notas micológicas XII: Stenocephalopsis subalutacea un discutido hongo hifomicetoso desde el aire de un museo de historia natural (Valparaíso, Chile) / Mycological notes XII: Stenocephalopsis subalutacea a discussed hiphomycete fungus from the air of a natural history museum (Valparaíso, Chile)

En esta nota micológica, se comentan los aspectos taxonómicos, ecológicos y fisiológicos de la especie fúngica Stenocephalopsis subalutacea, la cual fue aislada desde el aire del museo de historia natural de Valparaíso, Chile. Se confirma su identificación mediante observación de las características morfológicas.

In this mycological note, we discuss taxonomical, ecological and physiological aspects of Stenocephalopsis subalutacea fungus. This species was isolated from the air of the Natural History Museum of Valparaíso, Chile. We confirms its identification through morphology characteristic observation.

Especies oportunistas de importancia clínica de los géneros bipolaris shoemaker y curvularia boedijn: su caracterización bajo los nuevos criterios taxonómicos / Opportunistic species of clinical relevance in the bipolaris shoemaker & curvularia boedijn genera: its characterization under newest taxonomic criteria

Los géneros fúngicos Bipolaris y Curvularia,incluyen numerosas especies fitopatógenas,saprotrofas y algunas oportunistas emergentes enel ser humano como en otros animales. La distribuciónecológica de ambos taxas es cosmopolita enla gran mayoría de sus integrantes, encontrándosefrecuentemente en hojas, tallos y raíces de diferentespastos, en especial Poaceae, pero tambiénen una gran variedad de dicotiledoneas, aire y sueloen todos los continentes. Cochliobolus, Bipolarisy Curvularia integran un complejo de especiestaxonómicamente confuso, debido a los constantescambios en la nomenclatura de algunos de sus integrantesasexuales (Bipolaris y Curvularia), loscuales se han diferenciado principalmente en basea la morfología de sus conidios, situación a vecesmuy dificultosa debido a que en ambos génerosalgunas especies presentan similares característicasconidiales. Una cuidadosa identificación y unanominación precisa de las especies es crucial parael acceso a la información referente en la literaturamoderna, que gracias a la biología molecularha resuelto muchas de las dudas de la taxonomíabasada solo en el fenotipo.Las especies de ambos géneros (principalmenteCurvularia) pueden afectar a pacientesinmunocomprometidos e inmunocompetentes,en especial B. cynodontis, C. australiensis C.hawaiensis y C. spicifera, causando cuadros clínicosdiversos ya sea superficiales o profundos enmuchas áreas geográficas...

The fungal genera Bipolaris and Curvularia,include numerous plant pathogenic species,saprophitic and some emerging opportunistic inman and other animals. The ecological distributionof both taxa is cosmopolitan in the vast majority ofits members, often being in leaves, stems and rootsof different grasses, especially Poaceae, but also ina variety of dicotyledonous, air and soil on all continents. Cochliobolus, Bipolaris and Curvulariaintegrate a complex of species taxonomically confusingdue to the constant changes in the nomenclatureof some of its asexual members (Bipolarisand Curvularia), which are differentiated mainlybased on the morphology of its conidia, a situationsometimes very difficult because in both generaconidial of some species have similar characteristics. Careful identification and a precise nominationof species is crucial for access to informationconcerning in modern literature, actually thanks tomolecular biology has solved many of the doubtsof taxonomy based only on the phenotype.The species of both genera (mainly Curvularia)can affect immunocompetent or debilitatepatients, especially B. cynodontis, C. australiensis,C. hawaiensis and C.spicifera, causing varioussuperficial or systemic clinical cases in manygeographic areas...

Especies clínicas comunes del género scopulariopsis bainier y taxas relacionados / Common clinical species of the scopulariopsis bainier genera and related taxa

Los integrantes del género Microascus y su anamorfo Scopulariopsis, incluyen especies fúngicas comunes del suelo, excrementos, ambientes internos y algunas reconocidas como oportunistas en los animales, incluyendo al hombre. La sola morfología del género no siempre permite un buen diagnóstico a pesar de su utilidad cuando se presentan los anamorfos o teleomorfos o ambos. Sin embargo, la biología molecular ha permitido el análisis de muchos aislados clínicos, contribuyendo con nuevos aportes y nuevas combinaciones taxonómicas en la literatura actual. Este trabajo, reune lo más actual sobre estos géneros comunes en salud pública, aportando claves morfofisiológicas útiles para su reconocimiento primario en los laboratorios clínicos de baja complejidad.

Members of the genus Microascus and their anamorph Scopulariopsis, include common fungal species of soil, droppings, indoor environments and some recognized opportunistic in animals, including humans. The morphology of the genus alone is not always sufficient for a proper diagnosis despite its usefulness when anamorphs or teleomorphs or both are present. However, molecular biology has allowedthe analysis of many clinical isolates, contributing with new imput and new taxonomic combinations in the current literature. This work brings together the latest on these genera in pubblic health, providing a primary key for useful morphophysiological determination in clinical laboratory of low complexity.

Agentes comunes en las aspergilosis humanas: conceptos primarios en la diferenciación de sus complejos de especies / Common agent in human aspergillosis: primary concepts in their complex species differentiation

Las especies del género Aspergillus P.Micheli ex Haller, son consideradas como importantes organismos integrantes de la microbiota en distintos tipos de suelos en todas las latitudes. Presentan grandes capacidades fermentativas industriales, son agentes comunes en microbiología de alimentos, grandes biodescomponedores junto a las bacterias, contaminantes de productos agrícolas y de importancia en salud humana y animal. El género se asocia a 9 o más teleomorfos, formando un clado monofilético estrechamente relacionado con el género Penicillium. Debido al elevado número de especies, su dinámica taxonómica y sus frecuentes cambios en la nomenclatura, han complicado a menudo al investigador en algún campo de la biología, en especial cuando éste guarda relación con la industria o la medicina. Estos hongos productores de grandes cantidad de esporas secas de dispersión aérea, constituyen una fuente constante de exposición para los humanos, especialmente en los ambientes internos. Si bien es cierto, que los integrantes del género Aspergillus (en especial A. fumigatus) pueden causar un amplio espectro de enfermedades invasoras o no invasoras, la incidencia de otras especies del género reportadas en la literatura como agentes de aspergilosis, ha aumentado y complicado el trabajo taxonómico, genético y clínico en los últimos decenios. La presente revisión abarca el tema desde un punto de vista primario que incluye básicamente la morfofisiología de 34 especies involucradas en diversos casos clínicos geográficamente dispersos en todos los continentes. Se destacan algunos aspectos taxonómicos, ecológicos, patológicos, moleculares y el empleo de cultivos comunes en el diagnóstico en 3 de los subgéneros más frecuentes en clínica (Fumigati, Circumdati y Nidulantes) y 7 de sus secciones: Fumigati, Clavati, Nigri, Flavi, Terrei, Nidulantes y Usti...

Species of the genus Aspergillus P.Micheli ex Haller, are considered important members of the organisms of mycrobiota in different tipes of soils in all latitudes. They prsent large industrial fermentative capacity, are common agents in food microbiology, major biodeterioration agents with bacteria, contaminants in agricultural products, and important in human and animal health. The genus is associated with 9 or more teleomorphs, forming a monophyletic clade closely related to the genus Penicillium. Due to the high number of species, their taxonomic dynamic and frequent changes in nomenclature have often complicated the researcher in any field of biology, especially when related to industry or medicine. These fungi producing large amount of dry spores of aerial dispersion, and they are a constant source of exposure for humans, especially in indoor environments. While it is true, that members of the genus Aspergillus (especially A. fumigatus) can cause a wide spectrum invasive or non-invasive disease, the incidence of other species of the genus reported in the literature as agents of aspergillosis has increased and complicated the taxonomic, genetic and clinical work in recent decades. The present review covers the topic from a primary morphophysiology view and basically includes 34 species involved in various clinical cases geographically dispersed in all continents. It highlights some taxonomic, ecological, pathological and molecular aspects and the use of common culture media in the diagnosis in 3 of the most common clinical subgenera (Fumigati, Circumdati and Nidulantes) and 7 sections: Fumigati, Clavati, Nigri, Flavi, Terrei, Nidulantes and Usti...

Notas micológicas XI: Tritirachium oryzae, paecilomyces formosus y alcances en la sección fumigati de aspergillus con énfasis en el complejo Aspergillus viridinutans / Micological notes XI: tritirachium oryzae, paecilomyces formosus, and extent in the Section Fumigati with enfasis in thea aspergillus viridinutans complex

En estas notas micológicas, se comentan los aspectos taxonómicos, ecológicos fisiológicos y moleculares de 2 especies fúngicas filamentosas oportunistas en humanos tales como: Tritirachium oryzae y Paecilomyces formosus, poco conocidas en su distribución en Chile. Almismo tiempo se aportan datos recientes de la literatura referentes a la distribución y patología de los nuevos integrantes de de la sección Fumigati de Aspergillus, con énfasis en el complejo A. viridinutans, un grupo de especiemorfológicamente similares y generalmente oportunista en humanos y animales, las cuales no han sido biendefinidas en la últimas décadas.

In these notes, taxonomic, ecological, physiological and molecular aspects are discussed of two opportunisticfilamentous fungal species in humans, such as Tritirachium oryzae and Paecilomyces formosus, little known in its distribution in Chile. While recent literature data concerning the distribution and pathology of the newmembers of the Aspergillus section Fumigati contribute, emphasizing the complex A. viridinutans, a group ofmorphologically similar species and generally opportunistic in humans and animals did, which have not been welldefined in recent decades.

Diversidad y polimorfismo en el género Exophiala: manejo de las especies comunes en el laboratorio de baja complejidad / Diversity and polimorphism in the genus Exophiala: handling of common species in the low complexity laboratory

Exophiala es un género fúngico poco común, conocido como integrante de las levaduras negras y sus respectivas formas filamentosas que pertenece al orden Chaetothyriales. Estos hongos son causantes de cromoblastomicosis o diferentes tipos de faeohifomicosis en pacientes sanos o con compromiso inmune (cutáneas, subcutáneas, diseminadas y quistes de faeohifomicosis). Sus miembros son a menudo difíciles de clasificar a nivel de especie solo por métodos fenéticos, debido a su polimorfismo en cultivo y la gran diversidad molecular que exhiben, la cual se confirma en la revisión de la literatura en estos últimos 15 años. El objetivo de este estudio, se basa en la descripción y recopilación de las especies más comunes del género, presente en ambientes diversos y específicos, con especial atención a los principales aportes morfo fisiológicos útiles en su diagnóstico en un laboratorio de baja complejidad, sin olvidar que debido a su alto polimorfismo y la aparente similitud entre especie, el micólogo debe confirmar su hallazgo mediante el envío de su cepa a un laboratorio de referencia internacional para evitar el subdiagnóstico.

Exophiala is an uncommon fungic genus, known as integrant of black yeast and its filamentous relatives that belong to the Chaetothyriales order. This fungi produce cromoblastomicosis or different kinds of phaeohyfomycosis in healthy patients or immunocompromissed patients (cutaneous, subcutaneous, scattered and phaeohyfomycosis’s cysts). Its members are often hard to classify to species by only using phenetics methods, because they present polimorfisms in culture and shows great molecular diversity, wich is confirmed in the review of literature in the last 15 years. The aim of this study is the description and recopilation of the most common species of the genus, that is present in a variety or specific enviroments, with special enphasis onto the principal morfophysiologic contributions that are usefull to diagnose in a low complexity laboratory, given its high polymorfism and similar look between species, the mycologist must confirm its strain by sending it to an international reference laboratory in order to avoid underdiagnosis.

El complejo Pseudallescheria/Scedosporium y taxas afines en la rutina del laboratorio micológico clínico / The Pseudallescheria/Scedoporium complex and related taxa in the routine of clinic mycological laboratory

El complejo Pseudallescheria/Scedosporium y taxas relacionados, pertenecientes a un grupo de microhongos con conidios viscosos e integrantes del orden Microascales, se presentan en diversos ambientes comunes asociados a las actividades humanas, ya sea en el suelo como en aguas contaminadas. Actualmente se consideran entre los mayores grupos de hongos filamentosos oportunistas causante de infecciones cutáneas y profundas en el hombre y otros mamíferos. El objetivo principal de este trabajo, consiste en reunir los datos primarios morfofisiológicos más relevantes, útiles para el micólogo médico en el laboratorio, con el aporte adicional de algunos aspectos, biológicos, ecológicos, taxonómicos y moleculares complementarios descritos en la literatura moderna.

The Pseudallescheria/Scedosporium complex and their related taxa are a group of fungus that conidia are presents in viscous mass and belong to the order Microascales. They are in several common enviroment related to human activities either in soil as in contaminated water. Nowadays they are considerated one of the most opportunistic group of filamentous fungus that may cause superficial and deep skin mycoses infections in man and other mammalian. The aim of this work is to gather the primary relevant morphophysiological aspects, usefull to the medical mycologist in the laboratory, plus the contribution of some of biological, ecological, taxonomical and moleculars complementary aspects that are describe in modern literature.

Micosis pulmonares en pacientes de la Quinta Región: Período 2007-2010 / Frequency of pulmonary mycoses determined by analyzing lung secretion samples

Background: The frequency of pulmonary mycoses has increased in the past few years specially in immunocompromised patients. Aim: To determine the frequency of invasive fungal diseases by analyzing lung secretion samples. Material and Methods: Samples of bronchoalveolar lavage (BAL) tracheal aspiration (TA) and induced sputum (IS) were obtained from patients of five hospitals in the Valparaíso Region for the diagnosis of invasive or non-invasive fungal disease, and pneumocystis (PCP), in the period 2007-2010. Clinical data of patients was obtained reviewing medical records or interviewing attending physicians. The diagnosis considered the clinical condition of the patient (immunocompromised or prior lung damage), computed tomography imaging, direct microscopy and cultures. European Organization for Research and Treatment of Cancer/Mycoses Study Group (EORTC/MSG) criteria was used for the diagnosis of invasive fungal diseases. Results: Ninety respiratory samples were received and 39 fungal infections were diagnosed. Eleven were probably invasive, seven were non-invasive and 21 were PCP. All patients with probable invasive disease had neutropenia. Most patients with non-invasive infections had bronchiectasis. Aspergillus fumigatus was the main causing agent in both invasive and non-invasive fungal diseases. Patients with PCP were mostly adults with AIDS and children with leukemia. The total mortality rate of patients with invasive fungal disease was of 73%. No deaths were recorded among patients with non-invasive disease. Among patients with PCP, three of 11 HIV and six of 10 non HIV subjects died. Conclusions: Aspergillus fumigatus predominates both in invasive and non-invasive pulmonary mycoses. The former has a high mortality. PCP occurred mainly in adult patients with HIV-AIDS.

Micosis superficiales en la ciudad de Valparaíso, Chile: Período 2007-2009 / Superficial mycoses in the city of Valparaiso, Chile: Period 2007-2009

Introduction: Superficial mycoses are infections of the keratinous tissue caused by dermatophytes, yeasts and environmental fungi. Objectives: To identify the species of dermatophytes, yeasts and environmental fungi that cause superficial mycosis and analyze their differences by sex, age and location of the lesion, in patients from the region of Valparaiso, during 2007-2009. Materials and Methods: 1004 patients diagnosed with superficial mycoses were studied. All ages and both genera were included. The study was done using direct microscopic examination with 20 percent KOH and culture of the lesions. Fungi identification was mainly morphophysiological. Results: Of the 1004 patients studied, 609 were women and 87.7 percent was 15 years old or younger. Toenail onychomycosis was the most frequent lesion (58.1 percent), followed by tinea pedis and interdigitalis (16.3 percent). In patients younger than 8 years old, tinea capitis by Microsporum canis was the most common mycoses. Among dermatophytes, Trichophyton rubrum (78.9 percent) predominated in most locations, followed by Trichophyton mentagrophytes (14.9 percent) and M. canis (5.4 percent). Candida spp. (95.4 percent) prevailed among the yeasts causing onychomycosis. There were 27 cases of toenail onychomycosis caused by environmental fungi, mainly Fusarium. Conclusions: Our results are consistent with national and international data, where T. rubrum is the predominant agent of dermatomycoses. We report the emergency of agents not described in Chile or Latin America in these infections.

Introducción: Las micosis superficiales son infecciones causadas por dermatofitos, levaduras y hongos ambientales en tejidos queratínicos. Objetivos: Conocer las especies de dermatofitos, levaduras y hongos ambientales que causan micosis superficiales, analizar sus diferencias según sexo, edad y localización en pacientes de la Región de Valparaíso durante el período 2007-2009. Materiales y Métodos: Se estudiaron 1.004 pacientes de todas las edades, con diagnóstico de micosis superficiales. Se realizó examen microscópico directo con KOH al 20 por ciento y cultivos de las lesiones. La identificación de los hongos fue principalmente con morfo-fisiología. Resultados: De 1.004 pacientes evaluados, 609 fueron mujeres y 87,7 por ciento tenían sobre 15 años de edad. La onicomicosis de pie fue la lesión más frecuente (58,1 por ciento), seguida de tinea plantar e interdigital (16,3 por ciento). Bajo 8 años de edad, tinea capitis por Microsporum canis fue la lesión más frecuente. Entre los dermatofitos, Trichophyton rubrum (78,9 por ciento) predominó en la mayoría de las localizaciones, seguido por Trichophyton mentagrophytes (14,9 por ciento) y M. canis (5,4 por ciento). Entre las levaduras predominó Candida spp (95,4 por ciento) como causa de onicomicosis. Hubo 27 casos de onicomicosis de pies por hongos filamentosos ambientales, destacando por frecuencia el género Fusarium. Conclusiones: Los datos presentados coinciden en general con los trabajos nacionales e internacionales, donde T. rubrum predomina en la mayoría de las dermatomicosis. Destaca la aparición de agentes no descritos en Chile ni en Latinoamérica en este tipo de infecciones.

Enfermedad fúngica invasora en pacientes de cinco hospitales de la Región de Valparaíso, Chile: 2004 a 2009 / Invasive fungal disease in patients from five hospitals in the Valparaíso Region, Chile: 2004 to 2009

Introduction: Invasive fungal disease (IFD) is a frequent cause of morbidity and mortality in immuno-compromised patients. These infections are caused mainly by Candida albicans and Aspergillus fumigatus. Objectives: To describe IFD diagnosed by culture in adults and children from five hospitals in Valparaíso, Chile and to determine the species involved and the in vitro sensitivity oí Candida spp. Material and Methods: Biodemographical data, results of cultures, antifungal treatment and mortality after 30 days, was collected. The fungi were identified by standard methods and the sensitivity of the yeasts was obtained according to the M44-A CLSI document. Results: Fifty one IFD were diagnosed, 13 in patients with haematological malignancies and 10 in immunocompetent patients from the adult ICU. The following fungal species were isolated: 34 yeasts, 15 filamentous fungi and 2 Histoplasma capsulatum. There were 33 proven and 1 probable IFD by yeasts. By filamentous fungi, there were 6 proven and 9 probable IFD, 13 out of 15 isolated species were Aspergillus {A. fumigatus being the most frequent). C. albicans was the most frequent isolated yeast, followed by C. tropicalis and C. parapsilosis. All were sensitive to fluconazol and voriconazol, excepting C. glabrata. The mortality by Candida and by filamentous fungi was 42.42 percent and 86.66 percent respectively. Con-clusions: IFD was diagnosed mainly in immunocompromised and adult ICU patients. The mortality rate in IFD by filamentous fungi was higher than Candida group. The main agents involved were Candida albicans and Aspergillus fumigatus. A high sensitivity to fluconazol and voriconazol was found in strains of Candida.

Introducción: La enfermedad fúngica invasora (EFI) es una causa frecuente de morbimortalidad en pacientes inmunocomprometidos. Es provocada principalmente por Candida albicans y Aspergillus fumigatus. Objetivos: Describir las EFI diagnosticadas con cultivos en adultos y niños de cinco hospitales de la Región de Valparaíso, Chile, conocer las especies involucradas y para Candida spp determinar su sensibilidad in vitro. Material y Métodos: En cada caso se recopilaron antecedentes demográficos, cultivos, tratamiento antifúngico y mortalidad a 30 días. La identificación de hongos se realizó por métodos estandarizados y la sensibilidad de levaduras según documento M44-A del CLSI. Resultados: se diagnosticaron 51 EFI, destacando 13 en pacientes onco-hematológicos y 10 en inmunocompetentes de UCI adultos. Se aislaron 34 levaduras, 15 hongos filamentosos y en dos casos Histoplasma capsulatum. Hubo 33 EFI probabas por levaduras y una probable. En EFI por hongos filamentosos 6 fueron probadas y 9 probables; 13 de 15 especies aisladas fueron Aspergillus, siendo A fumigatus la más frecuente. Entre las levaduras predominó C. albicans, seguida de C. tropicalis y C. parapsilosis. Todas fueron sensibles a fluconazol y voriconazol, excepto C. glabrata. La mortalidad de EFI por Candida fue de 42,4 por ciento y de EFI por hongos filamentosos de 86,6 por ciento. Conclusiones: la EFI se diagnosticó principalmente en pacientes inmunocomprometidos y en pacientes de UCI adultos. La mortalidad de EFI por hongos filamentosos fue mayor que la causada por Candida. Los principales agentes fueron C. albicans y A. fumigatus. Existe una alta sensibilidad de las cepas de Candida spp a fluconazol y voriconazol.

Notas micológicas X: Spicellum ovalisporum y Rhizopus lyococcus dos nuevos aislamientos desde Avena sativa en Chile / Mycological notes X; Spicellum ovalisporum and Rhizopus lyococcus, two newest isolates from Avena sativa in Chile

En un análisis de muestras de semillas de avena (Avena sativa) provenientes de la zona sur de Chile (IX Región) y con la finalidad de detectar la micota fúngica presente en esta gramínea, se describen entre los hongos aislados, 2 especies no detectadas anteriormente en nuestro país: Spicellum ovalisporum y Rhizopus lyococcus. Se aportan los datos morfofisiológicos obtenidos de la primera especie y solo datos fenéticos de la segunda, por la imposibilidad de obtenerla en cultivos puros.

In an analysis of avena seed (Avena sativa) samples collected from southern Chile (XI Region) and in order to detect fungal micota present in this grain, two species not previously determined in our country : Spicellum ovalisporum and Rhizopus lyococcus are described. Morphophysiological information regarding the first species are submitted whereas only some phenetic data about the second one are reported because it impossibility to get it in pure cultures.

Hongos filamentosos en la epidermis del fruto del tomate: énfasis en el género Cladosporium link / Filamentous fungi in tomato fruit epidermis: emphasis in the genus Cladosporium Link

El tomate (Lycopersicum esculentum Mill) es uno de los frutos importantes en la dieta humana y como todo vegetal posee una variada microbiota epífita asociada ya sea saprofítica, fitopatógena u oportunista acorde a las zonas de cultivo, manejo y distribución de esta solanácea. Se determinó la ocurrencia, distribución e importancia de los hongos filamentosos epífitos de tomates sanos provenientes de ferias libres y locales establecidos en 2 períodos estacionales, entre abril 2008 y enero 2009. Se procesaron un total de 27 muestras (16 en otoño y 11 en invierno) mediante lavado de los frutos con agua destilada estéril, centrifugación y posterior siembra en medio PCA en duplicado. Se detectaron un total de 8288 colonias (ufc por 1 mL), que incluyeron 24 géneros y 34 especies de hongos filamentosos identificados mediante métodos morfofisiológicos (en especial Cladosporium). Se enumeró además la presencia de levaduras blancas, levaduras rosadas (sin identificación genérica) y bacterias (no incluidas en el análisis). Las especies de hongos filamentosos más frecuentes en ambos períodos fueron: Cladosporium cladosporioides (16,91 por ciento) C. sphaerospermum (9,31 por ciento), Geotrichum candidum (4,82 por ciento), Penicillium olsonii (3,51 por ciento) y Fusarium oxysporum (3,11 por ciento). Las levaduras blancas (35,49 por ciento) fueron similares en número a los integrantes del género Cladosporium en otoño, pero mayoritarias sobre este en invierno, mientras las levaduras rosadas (11,66 por ciento) fueron las segundas en importancias después de las especies de Cladosporium en otoño, pero muy inferiores en invierno. Se encontraron algunas diferencias significativas entre las muestras de otoño y las muestras de invierno en los siguientes géneros y/o especies: P. olsonii, C. cladosporioides y Fusarium spp., sin embargo, al comparar locales establecidos y ferias libres no se encontraron diferencias significativas. Se consideraron de interés clínico 11 especies...

Tomato (Lycopersicum esculentum Mill) is one of the important fruits designed for human diet and as a vegetal bears an associated and varied epiphytal microbiota, either saprophytic, fitopathogenic or opportunisticdepending on the sites of cultivation, handling and distribution of this solanaceous. The occurrence,distribution and importance of epiphytic filamentous fungi in healthy tomatoes collected from outdoor fairs and established shops were determined in two seasonal periods, within april 2008 and january 2009. Twenty seven samples (16 in fall and 11 in winter) were processed by means of fruit wash in distillate sterile water, centrifugation and further sowing in duplicate PCA medium. An 8288 total of colonies (ufc/1ml) was detected that included 24 genera and 34 species of filamentous fungi identified by means of morphophysiological methods (mainly Cladosporium). Besides the presence of white yeasts, pink yeasts (lacking generic identification) and bacteria (not included in the analysis) was determined. Most frequently occurring species of filamentous fungi, considering both periods were: Cladosporium cladosporioides (16.91 percent), C.sphaerospermu (9.31 percent), Geotrichum candidum (4.82 percent), Penicillium olsonii (3.51 percent) and Fusarium oxysporum (3.11 percent). White yeasts (35.49 percent) were similar in number to those belonging to the genus Cladosporium in fall yet higher than them in winter whereas pinkyeasts (11.66 percent) were in the second place of importance after the species of Cladosporium in fall yet had less importance in winter. Some significant differences were found among fall samples and winter samples in the following genera and/or species: P. olsonii, C. cladosporioides and Fusarium, however no significant differences were found on comparing established shops and outdoorfairs. Eleven species were considered to be of clinical interest in spite of the scarce presence of some of them inthe samples. However our...

Notas micológicas IX: comentarios acerca Botryosporium longibrachiatum var. longibrachiatum en Chile / Mycological notes IX: commentary about Botryosporium longibrachiatum var. longibrachiatum in Chile

Los integrantes del género Botryosporium Corda, (anamórfio Ascomycota, Pezizomycotina), hongos hialinos botriosos, de conidiogénesis sincrónica, se han reportado raramente en Chile y solo a nivel genérico. Se informa e ilustra el aislamiento de la especie B. longibrachiatum var. longibrachiatum en nuestra Región (Valparaíso), desde pellet de alimento canino, un especimen considerado como uno de los representantes más hermosos dentro del grupo de los llamados hyphomycetes. Basándonos en la literatura, se comenta su distribución, sus habitats comunes y los aspectos morfológicos en cultivo, destacando este hallazgo como un nuevo aporte a la diversidad de microhongos de Chile.

Members of the genus Botryosporium Corda, (Pezizomycotina, anamorph of Ascomycota) are hyaline filamentous fungi producing botryoblastospores by means of a synchronic conidiogenesis which are rarely reported in Chile, only at genus level. Herein the isolation of B.longibrachiatum var. longibrachiatum in our Region (Valparaíso) is described and illustrated, collected from canine food pellets, a specimen considered as one of the most beautiful representative within the group called hyphomycetes. Based on literature, its distribution, its particular habitats as well as its morphological aspects in culture are discussed, emphasizing this finding to be a new contribution to the diversity of microfungi in Chile.

Aportes morfotaxonómicos en el género Aspergillus link: claves para las especies ambientales y clínicas más comunes / Morphotaxonomic contributions in the genus Aspergillus Link: keys for the most common environmental and clinical species

Se condensan los principales alcances en el género Aspergillus y las metodologías de diagnóstico morfo-taxonómico de las especies más comunes de utilidad para el micólogo en áreas clínicas y ambientales. Se aporta información bibliográfica actualizada para las determinaciones polifásicas de las especies y algunas claves morfofisiológicas tentativas en ciertos taxa de importancia médica, con énfasis en la Sección Fumigati.

The main information about the Aspergillus genus together with methodologies for the morphotaxonomic diagnosis of the most common species useful for the mycologist in clinical and environmental areas are here condensed. An updated bibliography is forwarded in order to carry out polyphasic identification of the species as well as tentative morphophysiological keys in some taxa having medical significance with emphasis in Section Fumigati.

Coprophilous fungal community of wild rabbit in a park of a hospital (Chile): a taxonomic approach

During year 2005-through 2006 a study on coprophilous fungal communities present in wild rabbit dung was carried out in the park of a regional hospital (V Region, Chile), 21 samples in seven months under two seasonable periods (cold and warm) being collected. Sixty species and 44 genera as a total were recorded in the sampling period, 46 species in warm periods and 39 in the cold ones. Major groups were arranged as follows: Zygomycota (11,6 percent) Ascomycota (50 percent), associated mitosporic genera (36,8 percent) and Basidiomycota (1,6 percent). Ascomycetes genera having the highest occurrence were: Chaetomium (5), Saccobolus and Sordaria (3) Podospora, Schizothecium and Sporormiella (2). Constant and dominant species were : Chaetomium cuniculorum, Ch. murorum, Coprinus spp., Iodophanus carneus, Pilaira anomala, Schizothecium tetrasporum, Sordaria humana, Sporormiella teretispora and Stilbella fimetaria. Under a taxonomic approach focused on the majority of meiosporic fungi (Ascomycota), the presence of new records of fungi for Chile is emphasized: Fusariella hughesii, Neurospora caulospora, Pleuroascus nicholsonii, Rhytidospora bispora, Saccobolusglobuliferellus, among others.

Durante los años 2005-2006 se efectuó un estudio de las comunidades fúngicas coprófilos en excementos de conejos silvestres en un parque de un hospital regional (V Región, Chile), colectándose 21 muestras en 7 meses en 2 períodos estacionales (fríos y cálidos). Un total de60 especies y 44 géneros fueron detectados en el período de muestreo, 46 especies en los períodos cálidos y 39 en los fríos. La distribución de los grandes grupos fue: Zygomycota(11,6 por ciento), Ascomycota (50 por ciento), géneros mitospóricos asociados (36,8 por ciento) y Basidiomycota (1,6 por ciento). Los géneros de ascomycetes con mayor frecuencia de especies fueron: Chaetomium (5), Saccobolus y Sordaria (3) Podospora, Schizothecium y Sporormiella (2).Lasespecies constantes y dominantes fueron: Chaetomium cuniculorum, Ch. murorum, Coprinus spp., Iodophanuscarneus, Pilaira anomala, Schizothecium tetrasporum, Sordaria humana, Sporormiella teretispora y Stilbellafimetaria. Bajo un enfoque taxonómico orientado hacia la mayoría de los hongos meiosporicos (Ascomycota), sedestaca la presencia de nuevos registros para Chile: Fusariella hughesii, Neurospora caulospora, Pleuroascusnicholsonii, Rhytidospora bispora, Saccobolus globuliferellus, entre otros.

Reporte clínico: diagnóstico endoscópico e histológico de Aspergilosis Sinusal no invasiva en paciente inmunocompetente / Clinical report: an endoscopic and histologic diagnosis of a non invasive sinusal aspergillosis in an immunocompetent patient

Se describe un caso basado en un diagnóstico clínico, radiológico, endoscópico e histológico de una sinusitis crónica no invasiva en un paciente femenino de 40 años, con historia de rinorrea purulenta unilateral derecha de varios años de evolución. El TAC mostró velamiento del seno maxilar y calcificaciones con diagnóstico probable de infección micótica, sin embargo, no se solicitaron cultivos micológicos. Se indicó cirugía del seno maxilar mediante antrotomía media bajo endoscopia. El diagnóstico histológico reveló abundantes hifas septadas ramifi-cadas no invasivas de la mucosa sinusal con la presencia de algunas estructuras morfológicas asexuales que orientaron hacia un grupo taxonómico específico; Aspergillus sección Fumigati (posiblemente A. fumigatus). La evolución postoperatoria fue rápida y satisfactoria, sin requerir uso de antifúngicos, sólo aseos frecuentes de la cavidad operada hasta obtener una mucosa indemne y ventilada.

A case based on a clinical, radiologic, endoscopic and histologic diagnosis of a chronic non invasive sinusitis in a female 40 aged patient suffering from a purulent unilateral right rhinorrea which had been developing for several years is herein described. TAC revealed acertain masking of the maxilar sinus and calcifications which denoted a probable micotic infection yet mycological cultivations were not demanded. Surgery on the maxilar sinus by means of a medium antrotomy under endoscopy was indicated. The histologic diagnosisrevealed abundant non invasive septated, branched hyphae in the sinusal mucosa as well as some asexualmorphological structures which pointed to a particular taxonomic group; Aspergillus section Fumigati (possiblyA.fumigatus). Postoperatory evolution was fast and satisfactory since there was no need of using antifungaldrug, just frequent washing of the operated cavity until an undamaged and ventilated mucosa could be reached.

Reportes clínicos: infección probada por Aspergillus flavus y probable infección pulmonar por Emericella nidulans en pacientes inmunodeprimidos / Clinical reports: tested rhinosinusal infection by Aspergillus flavus and probable pulmonary infection by Emericella nidulans in immunodepressed patients

En los últimos 20 años la incidencia de aspergilosis invasiva ha aumentado entre 5 y 10 veces, presentando una mortalidad que varía desde un 60 a 98 por ciento dependiendo de su localización, enfermedad de base (inmunodepresión), diagnóstico y tratamiento precoz. A pesar que se ha logrado un importante avance en estos dos últimos decenios, aproximadamente un 50 por ciento de los casos se diagnostican post mortem. Se reportan dos casos de aspergilosis (probada y probable) en pacientes inmunodeprimidos de 21 y 44 años respectivamente. El primer caso corresponde a una infección rinosinusal en una paciente con leucemia linfoblástica, con un cuadro clínico caracterizado por aumento de volumen facial izquierdo, compromiso progresivo del estado general y equimosis en región periorbitaria. La endoscopia nasal detectó abundante secreción y tejido friable amarillento sugerente de infección micótica. Las muestras de tejidos enviadas al laboratorio para examen directo y cultivos arrojaron presencia de hifas en la mucosa y crecimiento abundante de Aspergillus flavus. Se inició terapia con itraconazol, cambiándose posteriormente a voriconazol, con respuesta favorable y disminución del dolor y volumen facial. Sin embargo, la paciente fallece al 10º día del ingreso debido a su mal estado general, avance de la falla medular y posterior insuficiencia respiratoria. El segundo caso corresponde a una probable infección pulmonar en una paciente con cáncer de mama en tratamiento quimioterápico. La paciente ingresó con el diagnóstico de neutropenia febril y probable neumonía de etiología bacteriana, fue tratada con antimicrobianos tanto en el hospital comunal como en el de base. Sin embargo, presentó una evolución tórpida, cursando posteriormente con hemoptisis, insuficiencia respiratoria y compromiso de conciencia. Se tomaron muestras de secreción endotraqueal las que fueron enviadas para estudio bacteriológico(TBC) y micológico, además de hemo y urocultivos. Los resultados de los...

In the lately twenty years the incidence of invasive spergillosis has increased five and ten times, causing a mortality rate ranging from 60 to 98 percent, depending on its location, nature of disease (immunodepression), diagnosis and forward treatment. In spite of the fact that there has been a significant progress in this lately period of twenty years, about 50 percent of cases were detected post mortem. Two cases of spergillosis (tested and probable) in 21 and 44 aged immunodepressed patients respectively are herein reported. The first case involves a rhinosinusal infection in a female patient diagnosed with lymphoblastic leukemia, whose clinical symptoms were an increase in the left volume of her face, a progressivecompromise in her overall state of health and ecchymosis in her periorbitary region. Nasal endoscopy revealed abundant secretion and yellowish friable tissues which suggested a mycotic infection. Samples of tissues sent to the lab for direct exam and cultures revealed the presenceof hypha in the mucus and an abundant growth of Aspergillus flavus. The first therapy was with itraconazol, changing later on to voriconazol what resulted in adecrease of pain and face volume. However, the patient dies on the tenth day of her ingress due to her bad state ofhealth, progress in glandular failure and ultimate respiratory insufficiency. The second case involves a probable pulmonary infection in a patient diagnosed with breast cancer and receiving chemotherapy treatment. She was ingressed with a febrile neutropenia and a probable bacterial etiology pneumonia and she was treated with antimicrobial medication both in the community hospital and in the base building. However, she showed a torpid evolution followed furthermore by hemoptisis, respiratory insufficiencyand consciousness compromise. Samples of endotraqueal secretion were taken in order to submit them to bacteriological and mycological (TBC) studies, together with hemo...

Poblaciones de Aspergillus en semillas de maíz y soja de importación Argentina: énfasis en la sección Flavi / Aspergillus population in maize and soja seed imported from Argentina: ephasis on section Flavi

Durante un período de 5 meses se realizaron muestreos seriados en granos de maíz y soja de procedencia Argentina para estudiar la presencia de especies del género Aspergillus (en especial los de la sección Flavi). Para ambos tipos de granos se tomaron 10 muestras mensuales obtenidas de un puerto terrestre (Los Andes, Chile), desde submuestras transportadas en bolsas plásticas y proporcionadas por personal de control sanitario. Los granos se sembraron por duplicado en placas de Petri, utilizando 2 medios: agar malta sal (AMS) y agar agua sal (AAS). Todos los Aspergillus, fueron transferidos posteriormente en agar malta (AM) y agar czapek con extracto de levadura (CYA), para su determinación morfológica final, análisis poblacional, frecuencia de presencia en el tiempo y la posible producción de aflatoxinas (sección Flavi) en medio de cultivo específico. En maíz y soja y en ambos medios, se detectó un total de 1669 colonias del género Aspergillus (1193 en AMS y 476 en AAS), representando 18 taxa, (17 en maíz y 15 en soja), éstos fueron en órden decreciente: Aspergillus flavus, Eurotium amstelodami, E. rubrum, A.ellipticus, A.niger, A.candidus, A.ochraceus, A.terreus, A.versicolor, A.glaucus, A. tamarii, A.clavatus, A.ostianus, A. sydowii, A. fumigatus, A.parasiticus, A.wentii y A. sclerotiorum. Los 5 primeros taxa representaron el 85,7 por ciento de la presencia total. En general en maíz y soja la especie dominante fue A. flavus, mientras E. amstelodami y E. rubrum fueron más frecuentes en soja. Los valores más altos de presencia en maíz fueron en julio y en soja en noviembre. A.flavus presentó alta dominancia en ambos granos, seguida con baja frecuencia de A.tamarii y A. parasiticus. Para un análisis morfológico poblacional se seleccionaron al azar 50 cepas de A. flavus de todos los subtratos y muestras. En AM y CYA, se observaron cabezas radiadas a columnareslaxas mayoritariamente, aproximadamente la mitad de las cepas presentaron cabezas biseriadas y los...

Serial sampling of maize and soja grainsimported from Argentina were carried out for five months in order to study the occurrence of Aspergillus species (mainly those of Flavi section). For both kind of grains, ten monthly samples collected from a terrestrial port (Los Andes, Chile) were taken from subsamples transferred in plastic bags and supplied by sanitary control personnel. Grains were cultured induplicate on Petri dishes by using two media: malt salt agar (AMS)and salt water agar (AAS). All Aspergillusdetected were lately transferred in malt agar (AM) and czapek agar added with yeast extract (CYA) to determine its ultimate morphological character,population analysis, frequency of occurrence in time and possible production of aflotoxins in Flavi sectionin a particular medium of culture.In maize and soja and in both media,1669 colonies of the genus Aspergillus(1193 in AMS and 476 in AAS) was detected, representing 18 taxa, (17 in maize and 15 in soja), which in decreasing order were:Aspergillus flavus, Eurotium amstelodami, E.rubrum, A.ellipticus, A.niger, A.candidus, A.ochraceus, A.terreus, A.versicolor,A.glaucus, A.tamarii, A.clavatus, A.ostianus, A.sydowii, Afumigatus, A.parasiticus, A.wentii and A.sclerotium. The first five taxa represented 85.7 percent of the overall total. In general, the dominant species was A.flavus in maize and soja, whereas E.amstelodamiand E.rubrum were most frequent in soja. Highest values of occurrence in maize were in july and in november, in soja. A.flavus exhibited high dominancein both grains followed by a low frequency of A.tamarii and A.parasiticus. Fifty strains of A.flavus were randomly selected from every substrate and sample in order to carry out a population analysis. In AM and CYA, radiated heads to columnar laxa were mostly observed, about half strains exhibited biserial heads whereas 7-14day conidia (measured with an image processer) did not reveal any further change in...

El entorno humano y la relevancia biológica de las especies de Neurospora: consideraciones en micologá médica / Human surrondings and the biological relevance of Neurospora species: considerations in medical mycology

A propósito de un caso clínico de peritonitis causado por el anamorfo de Neurospora intermedia (tipo de apareamiento A) en un paciente con antecedentes de insuficiencia renal crónica en peritoneodiálisis, se hace necesario comentar para el micólogo médico algunos alcances de la biología de los integrantes de este interesante género de ascomicete filamentoso. Se describen los aspectos históricos, ecológicos, morfológicos, taxonómicos, genéticos, filogenéticos y patológicos más relevantes de Neurospora, debido a su enorme contribución como modelo de organísmo en el desarrollo de la genética y la biología molecular.

Notas micológicas VIII: acerca de Thozetella tocklaiensis en aciculas senescentes de pino (Misiones, Argentina) / Mycological notes VIII: about Thozetella tocklaiensis in senescent leaves of Pinus (Misiones, Argentina)

Se describen los aspectos morfológicos de Thozetella tocklaiensis, un raro hongo anamórfico aislado en la litera vegetal senescente de Pinus elliottii en la provincia de Misiones (Argentina), mediante el empleo de diferentes medios de cultivo (PCA,PDA,CMA y OA), con o sin adicción de substratos vegetales tales como trozos estériles de tallos de Lolium bsp. y hojas de Musa sp. Se comenta la distribución de las especies y algunos aspectos filogenéticos del género. En todos los medios empleados se obtuvieron fructificaciones que permitieron su identificación a nivel de especie. Thozetella cristata, T. radicata, T. falcata y T. tocklaiensis producen sinnemata de variados tamaños y la morfología de este como la de los conidios y las setulas de T. falcata, T. havanensis y T. tocklaiensis son muy similares, difiriendo solamente en el largo y grosor de sus microaristas. T. falcata, T. boonjiensis también forman sinnemata sumergido en el agar al igual que T. tocklaiensis en PCA. Como la sola morfología resulta muy similar y existen estrechas relaciones entre algunas especies, parece ser que los estudios moleculares ser´´ian los únicos en poder determinar si el marcado polimorfísmo de los taxa observados en cultivos, corresponde más bien a cambios genéticos o a un fenotipo adaptativo de la especie en los diversos hábitat.